Origine et dynamique de l'infection par le VIH-1 de sous-type CRF02_AG en Algérie

Abstract

L’objectif de ce mémoire est d’étudier l’origine géographique et la dynamique de l’évolution de l’infection par le VIH-1, sous-type CRF02_AG en Algérie. 34 séquences CFR02_AG du VIH-1 env du gp120 de l'Algérie, ont été obtenues à partir de la base de données VIH de Los Alamos. Toutes les séquences du CRF02_AG env gp120 du VIH-1 en Algérie ont été utilisées pour l'analyse de l'origine géographique et 34 séquences du CRF02_AG env gp120 avec une année d'échantillonnage connue (de 2000 à 2003) ont été utilisées pour déterminer l'origine de l'infection par le VIH en Algérie. L’analyse phylogénétique des séquences env du VIH-1 a été utilisée pour rechercher l’origine géographique et le tMRCA du CRF02_AG algérien du VIH-1, y compris les profils d’évolution et les profils de croissance démographique du CRF02_AG algérien, en utilisant une approche bayésienne basée sur la coalescence modèles d'horloge. L’analyse phylogénique des souches identifiées a montré que le sous-type CRF02_AG est prédominant, alors que les sous-types non- CRF02_AG représentent une grande diversité qui provienne principalement de l’Afrique subsaharienne, probablement par le biais de l’immigration et par l’activité d'échange entre les différentes populations.