Genomic analysis of Coronaviruses
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UNIVERSITE MOHAMED BOUDIAF - M’SILA
Abstract
Cette étude présente une approche bioinformatique basée sur l’analyse
génomique comparative de coronavirus sélectionnés, incluant le SARS-CoV, le
SARS-CoV-2, ainsi que d’autres souches d’origine animale telles que les coronavirus
de chauves-souris, de pangolins, de porcs et de félins. À l’aide du logiciel BioEdit,
nous avons effectué la récupération des séquences, leur édition, leur alignement, la
traduction nucléotidique ainsi que la détection des mutations.
Dans cette étude, une analyse génétique de base a été réalisée sur plusieurs
souches de coronavirus provenant de différentes sources, incluant des hôtes humains
et animaux. Les échantillons comprenaient des séquences génomiques de coronavirus
humains tels que le SARS-CoV et le SARS-CoV-2, ainsi que des coronavirus
animaux isolés chez les chauves-souris, les pangolins, les félins et les porcs.
Toutes les séquences génomiques ont été extraites de la base de données
NCBI, puis traitées et analysées à l’aide du logiciel BioEdit. L’analyse s’est limitée à
la comparaison des séquences afin d’examiner les similitudes et les différences entre
les génomes de coronavirus sélectionnés, sans réaliser d’analyses évolutives avancées
ni de modélisation statistique complexe.Summary
Cette analyse génétique de base fournit un aperçu préliminaire du degré de
parenté génétique entre les coronavirus provenant de différents hôtes et constitue une
étape initiale vers la compréhension des relations génétiques potentielles entre les
coronavirus humains et animaux.