Genomic analysis of Coronaviruses

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UNIVERSITE MOHAMED BOUDIAF - M’SILA

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Cette étude présente une approche bioinformatique basée sur l’analyse génomique comparative de coronavirus sélectionnés, incluant le SARS-CoV, le SARS-CoV-2, ainsi que d’autres souches d’origine animale telles que les coronavirus de chauves-souris, de pangolins, de porcs et de félins. À l’aide du logiciel BioEdit, nous avons effectué la récupération des séquences, leur édition, leur alignement, la traduction nucléotidique ainsi que la détection des mutations. Dans cette étude, une analyse génétique de base a été réalisée sur plusieurs souches de coronavirus provenant de différentes sources, incluant des hôtes humains et animaux. Les échantillons comprenaient des séquences génomiques de coronavirus humains tels que le SARS-CoV et le SARS-CoV-2, ainsi que des coronavirus animaux isolés chez les chauves-souris, les pangolins, les félins et les porcs. Toutes les séquences génomiques ont été extraites de la base de données NCBI, puis traitées et analysées à l’aide du logiciel BioEdit. L’analyse s’est limitée à la comparaison des séquences afin d’examiner les similitudes et les différences entre les génomes de coronavirus sélectionnés, sans réaliser d’analyses évolutives avancées ni de modélisation statistique complexe.Summary Cette analyse génétique de base fournit un aperçu préliminaire du degré de parenté génétique entre les coronavirus provenant de différents hôtes et constitue une étape initiale vers la compréhension des relations génétiques potentielles entre les coronavirus humains et animaux.

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